據測算，韓美FTA簽定時，韓國的水產業產量減少，損失最少也在511億韓元以上，預計將會有更多的人改從事其他行業或者放棄漁業生產。

尤其遠洋漁業中，隨著黃姑魚和明太魚的進口國內水產漁業所受損失將從374億韓元增加到524韓元。偏口魚進口也使國內漁業所受損失從45億韓元增加到111億韓元。

韓國海洋水產開發院副委員長鄭明生在3日提交的“韓美FTA簽定給水產部門帶來的影響及考慮事項”報告書中指出，FTA簽定后，關稅撤消，每年水產品進口額將增加10-12%，冷凍明太魚和冷凍鱈魚的市場占有率將達到100%。金槍魚、魚子醬、紫菜（調制食用海藻類）、鮮魚涼粉、牙鲆等出口也將出現增長，但出口市場也將受到限制。安康魚、鱈魚、紅魚等水產品將成為新的進口產品。

鄭副委員長表示，要想將FTA簽定所帶來的損失達到最小化，應通過具體的結構調整，提供競爭力。對一些敏感產品應進行特別管理。