因?yàn)槌~捕撈藍(lán)鰭金槍魚(yú)，日本受到國(guó)際上的嚴(yán)厲指責(zé)。為此，日本水產(chǎn)廳決定重新考慮國(guó)內(nèi)現(xiàn)行的藍(lán)鰭金槍魚(yú)管理方式（關(guān)于“指定漁業(yè)許可和取締等省令”（1963年農(nóng)林水產(chǎn)省第5號(hào)）），實(shí)施個(gè)別配額管理制度（IQ）。該制度含有4方面內(nèi)容：1、日本農(nóng)林水產(chǎn)省對(duì)漁船捕撈量實(shí)施配額制度，禁止超額捕撈；2、捕撈藍(lán)鰭金槍魚(yú)必須貼上含有捕撈漁船名和順序號(hào)的標(biāo)簽；3、卸貨和轉(zhuǎn)載漁獲物時(shí)必須提供標(biāo)簽；4、禁止攜帶、加工和銷售超額捕撈藍(lán)稽金槍魚(yú)的產(chǎn)品。如若違反，將處以或“停船”，或2年以下拘留，或50萬(wàn)日元以下的罰款。

養(yǎng)護(hù)藍(lán)鰭金槍魚(yú)保存委員會(huì)（ CCSBT）決定2005年藍(lán)鰭金槍魚(yú)總捕撈配額為1.408萬(wàn)噸，其中日本的配額為6065噸。一直以來(lái)日本是通過(guò)抽簽方式在國(guó)內(nèi)進(jìn)行配額再分配，但是在去年的CCSBT會(huì)議上，澳大利亞指責(zé)日本漁船有超額捕撈行為，后經(jīng)過(guò)日本內(nèi)部調(diào)查，確證了事實(shí)，為此，日本水產(chǎn)廳決定改變過(guò)去的管理模式，在本來(lái)的配額中減掉超額捕撈部分后，再向國(guó)內(nèi)漁船個(gè)別分配。

對(duì)于超額捕撈行為，日本政府表示：多年來(lái)日本在國(guó)際上的形象一直是保護(hù)漁業(yè)資源的先鋒，而這種姿態(tài)在國(guó)內(nèi)也應(yīng)該一樣。為了確保日本在國(guó)際漁業(yè)舞臺(tái)上的地位，決不允許有損形象的行為發(fā)生。

另外，針對(duì)澳大利亞指責(zé)日本漁船對(duì)天然藍(lán)鰭金槍魚(yú)有超額捕撈行為及日澳雙方對(duì)養(yǎng)殖藍(lán)鰭金槍魚(yú)的調(diào)查報(bào)告存有爭(zhēng)議，日本和澳大利亞達(dá)成共識(shí)，決定從今年3月份開(kāi)始聯(lián)合調(diào)查藍(lán)鰭金槍魚(yú)的市場(chǎng)流通和養(yǎng)殖情況等。雙方各派兩名專家組成團(tuán)組進(jìn)行調(diào)查，調(diào)查結(jié)果將在今年7月份召開(kāi)的“特別會(huì)晤”上提交。