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        生命太復(fù)雜 學(xué)科融合將帶來顛覆式創(chuàng)新
        2021-11-01 11:10:14  來源:文匯報

        一場聚焦生命科學(xué)的論壇,為何數(shù)學(xué)家、物理學(xué)家、計算機(jī)科學(xué)家都來了?在舉行的第四屆世界頂尖科學(xué)家論壇·生命科學(xué)3.0和交叉研究論壇上,“復(fù)雜”,是這些“頂尖大腦”們對生命現(xiàn)象的共識。無論是蛋白質(zhì)還是大腦,其數(shù)量之龐大、結(jié)構(gòu)之復(fù)雜,都令人類既有的研究手段顯得相形見絀。

        而今,各學(xué)科的大交叉、大融合,正在推動生命科學(xué)從過去描述性、定性研究階段,向全局性、定量研究階段發(fā)展。這一過程帶來的巨大變化,甚至使年輕科學(xué)家“無需向前輩請教”,因為太多顛覆式創(chuàng)新可能無法預(yù)測。

        “我撰寫教科書《細(xì)胞生物化學(xué)》至今已有43年,但每次修訂,我都感覺有很多東西還沒弄明白。”2016年拉斯克醫(yī)學(xué)特別成就獎得主布魯斯·阿爾伯茨說,生命之復(fù)雜是他這輩子科研生涯中印象最深刻的事,“想要用簡單的網(wǎng)絡(luò)線路圖表現(xiàn)清楚生命體中的信號通路,離開數(shù)學(xué)和計算工具,是難以想象的”。

        事實上,早在上世紀(jì)四十年代,物理學(xué)家就已經(jīng)提出了類似想法,但學(xué)科之間的融合卻十分緩慢。“哪怕是最簡單的細(xì)胞,也有四百多個基因,每三小時分裂一次,并通過復(fù)雜的蛋白網(wǎng)絡(luò)協(xié)作,計算生物學(xué)在此類細(xì)胞分析研究中能起到很好的作用。”阿爾伯茨認(rèn)為,更深入理解生命現(xiàn)象,非常需要數(shù)學(xué)、物理等學(xué)科的介入,如果離開這些工具,人類對生命本質(zhì)的理解就如同“用小學(xué)一年級的詞匯與思維去理解莎士比亞作品”一樣茫然。

        他呼吁,青年科學(xué)家不要“趕時髦”,應(yīng)踏踏實實做好基礎(chǔ)研究。阿爾伯茨展示了一張照片,“我的研究團(tuán)隊成員來自各個不同國家,但我們一起工作”。他認(rèn)為,生命科學(xué)需要更多的開放,與更多學(xué)科融合,才能最終破解生命之謎。

        2020年圖靈獎得主阿爾弗雷德·艾侯認(rèn)為,計算生物學(xué)將生物、化學(xué)、計算機(jī)、醫(yī)學(xué)、物理、哲學(xué)等融合在一起,“它還有潛力融合更多學(xué)科”。最初的編碼器由IBM公司花費了18年才完成,而現(xiàn)在,一個計算機(jī)專業(yè)博士生就能開發(fā)出一個。在算力呈幾何級增長的當(dāng)下,計算生物學(xué)必將推動生命科學(xué)進(jìn)入一番新天地。

        2013年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎得主詹姆斯·羅斯曼也十分善于“跨界”,他早年學(xué)物理,又學(xué)過醫(yī)學(xué),然后轉(zhuǎn)向生命科學(xué)。從年輕時開始,他就喜歡嘗試將不同學(xué)科知識融會貫通來解決實際問題。13年前,他出任耶魯大學(xué)細(xì)胞生物學(xué)系系主任,就大量招收不同學(xué)科背景的年輕學(xué)者,以拓寬研究領(lǐng)域,營造學(xué)科交叉的氛圍。

        “在同一個系,有十幾名年輕教授都在從事同一方向研究,比如光鑷、單分子工具等,結(jié)果非常成功。”在羅斯曼看來,把研究路徑設(shè)得太明確不是一件好事,只有不斷互動,年輕科學(xué)家才能不停成長。

        毋庸置疑,生命科學(xué)發(fā)展受益于學(xué)科交叉融合。浙江大學(xué)求是講席教授周如鴻說,工業(yè)革命后,生命科學(xué)發(fā)生了兩次革命:第一次是從DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)到分子生物學(xué),第二次是從分子生物學(xué)到基因組學(xué),兩次革命都是數(shù)學(xué)、物理、計算機(jī)科學(xué)與生命科學(xué)交叉融合的巨大成果。接下來的第三次生命科學(xué)革命即21世紀(jì)的新生物學(xué),將實現(xiàn)從觀察性、定性到定量、可預(yù)測性的轉(zhuǎn)變,是生物學(xué)與定量科學(xué)和工程的交叉融合。

        然而,在1994年菲爾茲獎得主埃菲·杰曼諾夫看來,生命科學(xué)在21世紀(jì)的發(fā)展,很可能會成為數(shù)學(xué)學(xué)科發(fā)展的動力源泉之一。“在十六、十七世紀(jì),物理學(xué)的發(fā)展曾為推動數(shù)學(xué)作出過很大貢獻(xiàn),在21世紀(jì),很可能是生命科學(xué)。”

        事實上,生命科學(xué)研究遇到的大量問題,正在推動包括人工智能在內(nèi)的各種工具的發(fā)展。復(fù)旦大學(xué)教授馬劍鵬表示,目前蛋白質(zhì)動態(tài)維度研究正迎來最好時機(jī),蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)可通過實驗或計算機(jī)預(yù)測來確定,但動力學(xué)性質(zhì)只能通過計算機(jī)模擬來實現(xiàn)。上海紐約大學(xué)教授張增輝認(rèn)為,盡管“阿爾法折疊”等機(jī)器學(xué)習(xí)方法實現(xiàn)了精準(zhǔn)預(yù)測蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu),但仍有不少提升空間。

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