鰱鳙魚是典型的東亞特有鯉科魚類, 在我國是最大的經(jīng)濟魚類養(yǎng)殖群體, 為我國提供了大量的優(yōu)質(zhì)水產(chǎn)蛋白資源。有趣的是，“胖頭魚”等亞洲鯉魚作為中國暢銷美食，在美國卻有另一番景象。上個世紀70年代，美國的很多水域都會出現(xiàn)雜草和寄生蟲，便從我國引進了不少鰱、鳙魚等（與草魚、鯉魚一起被稱亞洲鯉魚）來解決這些麻煩，由于沒有天敵，又不是當?shù)氐氖秤敏~類，它們反而演變成入侵物種，泛濫成災。

近日，中國科學院水生生物研究所研究員何舜平團隊等在Molecular Ecology Resources在線發(fā)表了題為Whole genome sequencing of silver carp (Hypophthalmichthys molitrix) and bighead carp (Hypophthalmichthys nobilis) provide novel insights into their evolution and speciation的研究論文。研究人員利用短讀長測序技術(shù)，結(jié)合遺傳圖譜輔助掛載染色體的組裝策略，獲得連續(xù)性較好、準確度高的染色體水平的鰱魚和鳙魚基因組；同時對鰱魚20個野生樣本（珠江7個，黑龍江4個和長江9個），鳙魚22個野生樣本（珠江8個，黑龍江4個和長江10個）進行群體重測序分析。該研究揭示了東亞鯉科魚類的進化歷史，并進一步探討了鰱魚、鳙魚物種形成，群體分化的遺傳學基礎。

研究分析發(fā)現(xiàn)，包括鰱魚、鳙魚和草魚、團頭魴在內(nèi)的東亞鯉科魚類在920萬年前左右分化出來，東亞鯉科魚類在形成之后，物種快速進化并適應新環(huán)境，與其他鯉科魚類逐漸分化。其中最顯著的差異是鯉科魚類一般含有25條染色體，但是東亞鯉科魚類卻只有24條染色體，這是因為與斑馬魚同源的22號和10號染色體發(fā)生了融合。鰱魚、鳙魚的分化時間大概為360萬年以前，是兩個獨立物種，但具有非常近的親緣關系。群體基因組學分析檢測到從鳙魚到鰱魚的基因滲入，證明這兩個近緣物種之間可能存在自然雜交現(xiàn)象。同時，研究人員檢測物種分化的區(qū)域，主要和生殖過程和早期雌性發(fā)育相關，這些區(qū)域可能影響了兩個物種早期的物種分化，生殖隔離和環(huán)境適應。

水生所副研究員楊連東、博士甘小妮及深圳華大基因股份有限公司副研究員簡建波、高級分析工程師吳斌為論文共同第一作者，何舜平為論文通訊作者。該研究工作獲得了中科院戰(zhàn)略重點研究項目和國家自然科學基金等項目的資助和支持。

論文鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/1755-0998.13297