近年來，南海所質量與標準化技術研究中心在廣泛收集、研究國內外有關水產品標準和法規的基礎上，如世界衛生組織/聯合國糧農組織（WHO/FAO）下屬的國際食品法典委員會（CAC）有關水產方面的產品標準和操作規范、美國FDA有關規定、歐盟EEC系列強制性法規、日本厚生省法規，大力開展制定標準和研究標準技術課題工作，取得了喜人的成績。特別是在2005～2006年，成績更加突出，兩年間中心共承擔制定農業部行業標準8項，作為廣東省漁業標準技術歸口單位積極承擔廣東省地方標準，負責全省漁業標準的規劃，兩年來承擔制定的廣東省標準37項，占廣東省漁業標準制定的57%。由該中心制定的標準在2006年發布的有33項,其中行業標準3項、廣東省地方標準30項。

此外，作為廣東省水產品加工與質量安全控制委員會成員單位，廣東省FDA成員單位，中心積極參與廣東省地方質量安全監督與突發事件處理，如孔雀石綠事件、毒咸魚事件、甲基睪丸酮事件、硝基呋喃代謝物超標事件等，起草廣東省水產品質量安全監督政策建議，積極參與地方質量安全培訓與宣傳工作，先后6次聯合廣東省水產技術推廣站、廣東省漁業技能培訓站在省漁業局的組織下為水產養殖戶及加工企業培訓無公害水產品生產基礎知識、無公害水產品養殖和加工過程質量控制情況等，在全省范圍內培訓600多人次。

經過幾年的培育，該所水產品質量標準研究工作已拓展出一條新路子，并將繼續拓展研究范圍和研究深度，為我國水產品質量安全控制提供技術支撐。