近日，由黑龍江所梁利群研究員主持的“魚類耐鹽堿性狀轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究”課題組采用羅氏454測(cè)序平臺(tái)，分別完成了堿水、淡水雅羅魚鰓、腎組織的轉(zhuǎn)錄組表達(dá)差異研究。

研究中測(cè)序共得到1,826,022條序列，其中有效序列1,683,616條，平均長(zhǎng)度298bp。序列經(jīng)Newbler軟件拼接得到30,606個(gè)contigs，平均長(zhǎng)度為1,022bp。蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)發(fā)現(xiàn)，19,196個(gè)contigs具有明確的生物學(xué)功能，與斑馬魚匹配的同源蛋白多達(dá)16，000條；數(shù)字差異表達(dá)譜分析顯示，共有2247個(gè)基因在堿水、淡水雅羅魚的鰓、腎組織中發(fā)生顯著變化，其中在堿水中上調(diào)基因1049個(gè)，下調(diào)基因1198個(gè)。目前測(cè)序數(shù)據(jù)的初步分析、整理工作已接近尾聲，數(shù)據(jù)深度挖掘工作正在有序進(jìn)行中。

本項(xiàng)研究工作對(duì)揭示魚類耐鹽堿機(jī)理、培育性狀優(yōu)良的魚類耐鹽堿新品種，具有十分重要的科學(xué)意義。