近日，淡水漁業(yè)研究中心長江重要種質(zhì)資源評(píng)估與保護(hù)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)首次發(fā)布長麥穗魚（Pseudorasbora elongata）和長體鱖（Siniperca roulei）高質(zhì)量染色體水平基因組，在珍稀瀕危魚類種質(zhì)資源解析領(lǐng)域研究上取得新進(jìn)展

長麥穗魚和長體鱖為我國特有魚類，具有重要的生態(tài)和研究價(jià)值。然而受人類活動(dòng)及極端氣候影響，棲息地功能快速喪失，自然種群規(guī)模銳減，均被《中國瀕危動(dòng)物紅皮書·魚類》收錄，其中長麥穗魚已被列為安徽省重點(diǎn)保護(hù)野生動(dòng)物。由于缺乏對(duì)種質(zhì)資源的深入了解，嚴(yán)重制約了保護(hù)生物學(xué)工作進(jìn)展。為全面解析其種質(zhì)資源特性，團(tuán)隊(duì)結(jié)合PacBio HiFi長讀長、Hi-C及Nanopore超長讀長測序?qū)﹂L麥穗魚和長體鱖進(jìn)行了端粒到端粒（T2T）組裝，獲得了兩個(gè)物種的高質(zhì)量基因組。基因組總長度分別約為1.4 Gb和717.34 Mb，scaffold N50達(dá)到53.7 Mb和30.25 Mb，其中長體鱖基因組達(dá)到無缺口（gap-free）水平，精準(zhǔn)定位所有染色體端粒和著絲粒，組裝完整性和連續(xù)性顯著優(yōu)于已發(fā)表的鱖類基因組數(shù)據(jù)。

上述研究揭示了長麥穗魚和長體鱖基因組結(jié)構(gòu)特征、基因功能及與近緣種的演化關(guān)系，首次從基因組層面厘清長體鱖的分類地位，為我國瀕危魚類種質(zhì)資源保護(hù)提供了科學(xué)支撐，也為下一步結(jié)合群體基因組學(xué)等多組學(xué)技術(shù)探究種群瀕危機(jī)制提供素材。

該研究工作得到安徽省重點(diǎn)水域水生生物監(jiān)測項(xiàng)目（2023AHNYNC016XQ）、中國水產(chǎn)科學(xué)研究院中央級(jí)公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金資助（2023TD11）等項(xiàng)目的支持。相關(guān)成果相繼發(fā)表于國際期刊《Scientific Data》和《Gigascience》上。淮漁中心王盼、姜敏分別為第一作者，劉凱研究員為通訊作者。

全文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41597-025-04890-4

https://doi.org/10.1093/gigascience/giaf068