大口黑鱸是我國重要的淡水養(yǎng)殖品種，2023年全國養(yǎng)殖產(chǎn)量達到88.80萬噸，在國民經(jīng)濟中占有重要地位。目前大口黑鱸國審新品種僅有2個，新品種的數(shù)量與大口黑鱸養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)規(guī)模不匹配。亟需開發(fā)新的新品種，尤其是具有抗逆等性狀的新品種。研發(fā)創(chuàng)制基因組芯片，可以為加速大口黑鱸的育種進程，提高育種效率奠定基礎(chǔ)。

中國水產(chǎn)科學研究院珠江水產(chǎn)研究所鱖鱸基因組學與選擇育種創(chuàng)新團隊與康普森生物技術(shù)有限公司合作，利用CAGT?（Compass Agriculture Genomic Technology）靶向捕獲測序技術(shù)，研發(fā)了具有自主知識產(chǎn)權(quán)的大口黑鱸50 K液相育種芯片“鱸芯1號”。該芯片可應(yīng)用于大口黑鱸種質(zhì)資源鑒定、遺傳多樣性評估、基因定位與挖掘鑒定、全基因組關(guān)聯(lián)分析、分子輔助定向改良和基因組育種等不同場景，為大口黑鱸遺傳研究和品種選育提供了高效基因型鑒定工具。利用該芯片將來可進一步研發(fā)低密度芯片，降低選育成本，助力大口黑鱸全基因組選育和良種創(chuàng)新研究。

該芯片位點多態(tài)性高、基因組分布均勻，位點在染色體上的平均覆蓋率為99.65%，平均間距17 Kb。性狀關(guān)聯(lián)位點豐富，芯片包括團隊前期研究篩選獲得的多個功能位點，可用于生長、性別和抗病毒等重要性狀的精準鑒定和生產(chǎn)應(yīng)用。“鱸芯1號”技術(shù)性能優(yōu)良，而且芯片穩(wěn)定性好，基因分型準確度高，測試結(jié)果顯示平均位點檢出率達99.95%，重復(fù)樣本基因型平均一致率為99.95%。

負責“鱸芯1號”研發(fā)的核心成員包括崗位科學家高風英特聘研究員，董浚鍵助理研究員、孫成飛副研究員、葉星研究員等。“鱸芯1號”的研制得到國家特色淡水魚技術(shù)體系淡水鱸種質(zhì)資源與品種改良崗位（CARS-46）、中國水產(chǎn)科學研究院基本科研業(yè)務(wù)費（2023TD95）等項目的支持。

圖1 大口黑鱸50 K育種芯片檢測試劑盒

圖2 大口黑鱸50K CAGT液相育種芯片標記位點在染色體上的分布

圖3 “鱸芯1號”檢測效果