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        珠江所對魚類DNA 條形碼數(shù)據(jù)庫的開發(fā)取得進展
        2024-06-05 16:56:47  來源:珠江水產(chǎn)研究所

        近日,珠江水產(chǎn)研究所觀賞漁業(yè)研究室在國際學(xué)術(shù)期刊《Database》(JCR 1區(qū),IF2022=5.8)在線發(fā)表“CoSFISH: a comprehensive reference database of COI and 18S rRNA barcodes for fish”的研究論文。該研究得到了中國-東盟海洋合作基金(CAMC-2018F)、2022年省級鄉(xiāng)村振興戰(zhàn)略專項種業(yè)振興行動(2022SBH00001)和國家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫(FGRC18537)等項目資助。珠江所為論文第一單位,王媛媛博士為第一作者,牟希東研究員為通訊作者。

        魚類種類繁多,準(zhǔn)確的物種鑒定是不可或缺的基礎(chǔ),構(gòu)建一個詳盡的魚類參考數(shù)據(jù)庫是必要的。在國家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫珠江分庫和廣東省淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫基因庫的基礎(chǔ)上,結(jié)合從FishBase網(wǎng)站收集基本的魚類物種信息,建立了一個包含線粒體基因COI和核基因18S rRNA條形碼的魚類綜合參考數(shù)據(jù)庫——CoSFISH。CoSFISH包含了21535條COI條形碼和1074條18S rRNA條形碼,涵蓋了21589種魚類,分別隸屬于8個綱和90個目。這一數(shù)據(jù)庫的建成為魚類多樣性、系統(tǒng)發(fā)育學(xué)和生物進化研究提供了數(shù)據(jù)支撐。

        全文鏈接:https://doi.org/10.1093/database/baae038

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