近日，珠江水產研究所珠江漁業資源調查與評估創新團隊在國際學術刊物《GENE》發表了題為“Whole-genome resequencing confirms the genetic effects of dams on an endangered fishHemibagrus guttatus(Siluriformes: Bagridae): A case study in a tributary of the Pearl River”的研究論文。該研究得到廣東基礎和應用基礎科學基金資助項目（2020A1515110252）的資助。珠江所為論文第一完成單位，陳蔚濤副研究員為論文的第一作者，李捷研究員為論文的通訊作者。

梯級水壩引起的生境破碎化會導致基因漂變、近親繁殖、瓶頸效應等，從而降低魚類的種群遺傳多樣性，增加隔離種群的遺傳分化。珠江水系梯級開發嚴重，給漁業資源的可持續發展造成了巨大的威脅。然而，珠江水系梯級開發對魚類影響的相關研究相當匱乏，在遺傳層面上更是一片空白，這極大阻礙了梯級開發背景下魚類的保護和管理策略的制定。本研究選擇北江支流連江珍稀瀕危物種斑鳠為研究對象，測定了6個梯級隔離群體的全基因組重測序數據，綜合系統發育構建、遺傳群體分析、離群位點分析等方法，發現所有研究群體都呈現出較低的核苷酸多樣性與有效種群大小以及較高的Tajima’sD值和近交系數，表明梯級開發可能影響了連江斑鳠群體的遺傳多樣性和有效種群規模，并且這些群體可能受到了遺傳漂變與頻繁近交的影響，其中梯級大壩最上游的連州群體影響最為嚴重，甚至形成了相對獨立的遺傳種質背景。與此同時，分析發現不同隔離群體之間在核基因組水平和線粒體基因組水平上都存在顯著的遺傳分化，暗示梯級大壩可能限制了它們之間的基因交流。本研究從基因組視角找到了梯級開發對瀕危物種斑鳠遺傳多樣性與遺傳結構影響的一些證據，為梯級開發情景下該物種的保護提供了重要啟示。

論文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.gene.2023.148000